甘肃黄河首曲国家级自然保护区管护中心前身为甘肃黄河首曲湿地省级自然保护区管理站，2013年12月，经国务院办公厅批准晋升为国家级自然保护区。2018年8月，甘肃省机构编制委员会办公室批准成立甘肃黄河首曲国家级自然保护区管理局，为省林业和草原局所属事业单位，正处级建制，核定事业编制46名（2024年机构改革缩编至41名）。2021年5月，更名为甘肃黄河首曲国家级自然保护区管护中心。

甘肃黄河首曲国家级自然保护区管护中心属全额拔款事业单位，内设9个正科级机构，分别为办公室、组织人事科、计划财务科、湿地管理科、科研监测科及河曲马场保护站、曼日玛保护站、采日玛保护站、卫当保护站。

甘肃黄河首曲国家级自然保护区位于甘肃省南部的甘南藏族自治州玛曲县境内，地处甘、青、川三省交界处，黄河第一弯曲部。保护区总面积203057.90公顷（约305万亩），约占属地玛曲县国土总面积的20%。区内林草湿面积分别为：林地面积为4435.57公顷（约6.6万亩），草地面积为73886.12公顷（约111万亩），湿地面积123112.94 公顷（约180万亩）。保护区属于“内陆湿地和水域生态系统类型”自然保护区，是青藏高原湿地最具代表性的区域，是青藏高原和大若尔盖湿地的重要组成部分，是黄河上游重要的水源补给区和生态功能区，被称为黄河上游的“蓄水池”和“高原水塔”。

2020年2月《湿地公约》秘书处按程序核准甘肃黄河首曲湿地正式列入《国际重要湿地名录》，是全国第62块，甘肃省第4块国际重要湿地。面积为甘肃省之最，达132067公顷。